Den første dagen på videregående uttaler Haruhi Suzumiya en kunngjøring som forbløffet alle: «Jeg har ingen interesse for vanlige mennesker. Hvis noen her er en fremmed, tidsreisende, skyveknapp eller esper, kom og se meg! Det er alt." Kyon, et helt normalt menneske som tilfeldigvis har ulykken med å sitte ved pulten foran Haruhi, lurte på om hun tullet. Men Haruhi Suzumiya er alltid seriøs. Alltid. I alle fall hadde Kyon absolutt ikke tenkt å bli involvert i hennes narrestreker. Men når en uformell samtale ved et uhell gir Haruhi ideen om å danne en klubb dedikert til oppdagelsen og etterforskningen av mystiske fenomener, oppdager Kyon at han allerede er over i hodet, spesielt når Haruhi gjør ham til sin første rekrutt. Andre medlemmer av klubben inkluderer Nagato Yuki, en stille, bokaktig jente; Mikuru Asahina, en altfor søt jente valgt av Haruhi til å være klubbens "maskot"; og Koizumi Itsuki, en alltid smilende gutt valgt av Haruhi til å spille rollen som "mystisk transferstudent". Og så er SOS Brigade født! Ting blir bare rarere og vanskeligere for Kyon, men når han finner ut at Haruhi uvitende har omgitt seg av de menneskene hun har ønsket hele tiden å oppdage: Nagato Yuki er faktisk en fremmed, Asahina Mikuru er en tidsreisende, og Koizumi Itsuki er en esper! Og hvorfor har alle disse menneskene dukket opp i utgangspunktet? Hvorfor, for Haruhi, selvfølgelig! For tre år siden forårsaket Haruhi en slags forstyrrelse som hver av dem finner det verdt å undersøke. Og Kyon, uansett grunn, ser ut til å være den eneste “normale” i hele gruppen. Hans største spørsmål: hvorfor han?
