UC 0097, ett år etter åpningen av "Laplace's Box".
Til tross for avsløringen av Universal Century Charter som anerkjenner eksistensen og rettighetene til Newtypes, har ikke verdens rammer blitt endret sterkt.
Konflikten senere kalt "Laplace Incident" antas å ha endt med fallet av Neo Zeon-restene kjent som Sleeves. I sin siste kamp viste to fulle psykodrammer mobile drakter kraft utover menneskelig forståelse. Den hvite enhjørningen og den sorte løven ble forseglet for å fjerne denne faren fra folks bevissthet, og de skulle nå være helt glemt.
Imidlertid er RX-0 Unicorn Gundam 03, som forsvant to år tidligere, nå i ferd med å vise seg i Earth Sphere nok en gang. En gyllen feniks ... kalt Phenex.
