Historien ligger i den fjerne fjellandsbyen Okukozome-chou. Haruka Kazugano og hans tvillingsøster Sora har gode barndomsminner fra å dra til landsbyen for å besøke bestefaren i sommerferien. Etter å ha mistet foreldrene i en ulykke, må de to imidlertid flytte inn sammen med bestefaren.
Tvillingene blir kjent igjen av sin gamle barndomsvenninne Nao Yorihime, deres nye klassekamerat Ryouhei Nakazato, miko (helligdomspiken) Akira Amatsume, og Akiras venn Kazuha Migiwa. Alt virker fredelig og kjent. Under overflaten er det imidlertid et hemmelig løfte om tvillingene som ble gjort med hverandre for lenge siden, hvor en viktig tapt gjenstand befant seg, og den virkelige grunnen til at de valgte å komme tilbake hit.
