Negi Springfield, en 10 år gammel tryllekunstner, ønsker å til slutt bli en "Magister Magi", en bestemt tryllekunstner som, under dekke av å operere under en frivillig organisasjon, bruker sine krefter til å hjelpe vanlige individer. Etter endt utdannelse fra Merdiana Magic Academy i Wales, kunne han få delegert jobben med å undervise i engelsk på ungdomsskolen, der hjemmekurset hans består av 31 døtre, hver ganske spesiell på sin helt egen måte av Mahora Academy. Showet beskriver opplevelser og hans tid i Japan når han hjelper dem i deres problemer, oppnår godkjenning og respekt fra elevene sine, og konfronterer magiske farer både fra innsiden og utenfor Mahora Academy. Negis hovedforhold er med Asuna Kagurazaka, romkamerat og hans elev, som ikke liker ham innledningsvis, men etter å gjenkjenne ham som en venn og blir hans følgesvenn, selv om alle kvinnene har hennes helt egen rygghistorie og karakter. Han jakter også på faren sin som heter tusenmesteren.
Mens det i utgangspunktet virket som et annet romantisk komedieverk med en rekke bish? Jo-figurer som Love Hina, showet, har det gått videre til en blanding av shenen-romantikk, fantasi, skrekk, action og komedie. Akamatsu sa at han spesielt ønsket å gjøre noe “annerledes” enn Love Hina. Negi selv er prepubescent, og flere av scenene hans med Asuna er unike varianter av den "vanskelige romantiske scenen" trenden med harem manga, umiddelbart avlatt og bare spilt for latter. I tillegg er det mange av jentene som ikke klarer å gå over ham i en barnslig forstand uten forventninger som er intime hos leseren [studie som er unik?]
For å opprettholde denne spesielle moten, regnes Negi selv som andre typiske mannlige leder av manga, samt en sammenligning med Love Hina's Keitaro Urashima. Han er hardtarbeidende, kompetent og behandlet vennlig, men på grunn av sitt utseende og alder (godt under flertallet av elevene), føler han seg helt ikke-truende og synes det er vanskelig å bli tatt på alvor som lærer; flere av elevene hans håndterer ham som et lurt lite barn, om ikke en lekekamerat (eller leketøy)
