Er (Yuuki Homura)

I den nærmeste fremtiden konstruerer en japansk forsker et drevet eksoskelett kalt “Infinite Stratos” (IS). IS besitter teknologi og kampmuligheter langt mer avansert enn noe annet våpensystem, og truer med å destabilisere verden. Stilt overfor et så overveldende våpen vedtar verdens nasjoner "Alaska-traktaten", som sier at IS aldri vil bli brukt til militær kamp, ​​og at eksisterende IS-teknologi må fordeles likt til alle nasjoner, for å forhindre at en nasjon dominerer de andre. Innføringen av IS har imidlertid stor innvirkning på samfunnet. Ettersom IS bare kan drives av kvinner, brytes maktbalansen mellom menn og kvinner, og kvinner kommer til å dominere samfunnet over menn.
Ti år etter at den første IS ble introdusert, har verden gått inn i en ny tids fred. Freden knuses imidlertid av en uventet oppdagelse. En 15 år gammel japansk gutt, kalt Ichika Orimura, blir oppdaget å være i stand til å operere en IS. Når jeg realiserer potensialet, blir Ichika av den japanske regjeringen tvunget til å delta på det prestisjetunge Infinite Stratos Academy, et internasjonalt akademi der IS-piloter fra hele verden trener. Dermed begynner hans travle skolehverdag omgitt av jenter.